Thailand vindt dat de tempel op zijn grondgebied ligt, maar de kaart uit 1907 heeft hem in Cambodja gelegd. Ook over 2 kleinere tempels langs de lange gedeelde grens is discussie. 

In 1962 bevestigde het Internationaal Gerechtshof, de hoogste rechtbank van de VN, dat de Preah Vihear-tempel in Cambodja ligt, maar Thailand blijft aanspraak maken op het omliggende gebied.

Wanneer de tempel in 2008 een plaats krijgt in de Werelderfgoedlijst van UNESCO, lopen de spanningen tussen Thailand en Cambodja opnieuw op. De daaropvolgende jaren komt het nu en dan tot onlusten, waarbij ook doden vallen. In 2013 trekt Cambodja opnieuw naar het Internationaal Gerechtshof, en opnieuw krijgt het daar gelijk.